Sıvı kromatografide, yüksek basınç altında bir sıvı (mobil faz / elüent), bir sıvı (sabit faz) içinde kaplanabilen ince bir toz ile paketlenmiş bir inert tüp (kolon) içinden akar. Kolondan önce eluente bir numune enjekte edilir; kolon boyunca hareket ederken, numunedeki her bir bileşik tarafından kolonun sonuna ulaşmak için geçen süre, eluent ve sabit faz ile etkileşimi tarafından yönetilir. Bu, bileşiğin özelliklerine bağlıdır ve çok benzer bileşiklerin karışımlarını ayırmak için kullanılabilir. Ayrıldıktan sonra bileşikler, kolondan çıktıklarında hem seçici olmayan hem de seçici olan, kütle spektrometreleri dahil olmak üzere bir dizi detektör tarafından ölçülebilir.