Su, spektrofotometride en büyük hacimlerde kullanılan reaktiftir ve özellikle yüksek hassasiyetli uygulamalarda saflığı önemlidir. Bunlar, numune ön işlemi ve reaktifler, boşluklar ve standartların hazırlanması için su gerektirecektir. Suda bulunan safsızlıklar hataları ve sürüklenmeyi artırabilir ve doğruluk üzerinde potansiyel olarak ciddi etkileri olan ekstra veya genişlemiş tepeler oluşturabilir. Otomatik sistemler içinde uzun süreli kirlilik birikimi, bileşenlerin kaymasına ve bozulmasına neden olabilir.