Mikroorganizmalar, bir dizi teknoloji, en yaygın olarak mikrobiyal kültürler, immünolojik testler - enzime bağlı immünosorbent tahlilleri (ELISA'lar) ve polimeraz zincir reaksiyonları (PCR'ler) kullanılarak incelenebilir.

Mikrobiyal kültürler, mikroorganizmaları kontrollü laboratuar koşulları altında sıvı veya katı olabilen belirli kültür ortamında yetiştirerek çoğaltmanın bir yoludur. Organizmanın türünü, test edilen örnekteki bolluğunu ve antimikrobiyal ajanlara duyarlılığını belirlemek için kullanılırlar. İmmünolojik testler, hedef mikroorganizmaya özgü spesifik proteinleri tespit etmek ve tanımlamak için antikorları kullanır. Kantitatif olabilirler, ancak daha sıklıkla ilgili analitin varlığını veya yokluğunu belirleyen kalitatif tahlillerdir. Tekli ve çoklu PCR'ler daha yeni bir gelişmedir. Bu nükleik asit bazlı test, araştırılan mikroorganizmaya özgü DNA veya RNA segmentlerininamplifikasyonunu ve tanınmasını sağlar. Kullanılan yöntem ne olursa olsun, mikrobiyolojik analiz sırasında oluşan kontaminasyonu önlemek esastır.